广西PRRSV分离株GXNN1396全基因序列分析

• 作者: 何荣祥 林思远 洪绍锋 陈樱 韦祖樟 韦莹 黄伟坚 黄加滨
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 全基因序列分析 同源性分析 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 3326字
• 语种: 中文

摘要

前期我们实验室分离鉴定了一株nsP2蛋白缺失49个氨基酸(aa)的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)GXNN1396株.为了进一步对该毒株全基因组序列特性进行分析,将GXNN1396株病毒在Marc-145细胞上传至第3代,收集细胞上清,抽提该病毒RNA.用RT-PCR检测方法对GXNN1396基因组进行分段扩增、克隆、序列比较和遗传进化分析.结果表明,GXNN1 396全长15 263核苷酸(nt),不包括5'帽子结构和3'Poly A尾.其中,5'非翻译区(5'UTR)长为189 nt,3'UTR长151 nt,ORF1a、ORF1b、ORF2、ORF3、ORF4、ORF5、ORF6、ORF7分别为7 422、4 382、771、765、537、603、525 nt和372 nt.与国内外的PRRSV毒株核苷酸序列的同源性进行了比较显示,GXNN1396与欧洲经典毒株LV和VR2332株的同源性分别为61％和88.8％,与TJ、JXwn06、JXA1在全基因上的同源性高达97.2％～97.3％,说明GX-NN1396株是一株典型的美洲型PRRSV毒株.遗传进化分析表明美洲型PRRSV主要分为3个亚群,GX-NN1396与高致病性PRRSV毒株属于同一分支.