基于反向分子对接的虫草素和三磷酸虫草素的生物活性

• 作者: 张国财 张星耀 田树新 程功 马玲
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛹虫草 虫草素 三磷酸虫草素 分子模拟 靶标蛋白 自由结合能
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 生物科学与技术
• 页码范围: 262-267
• 页数: 6页
• 分类号: Q591.2
• 字数: 4203字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2016.03.008

摘要

分别采用idTarget、PharmMapper在线反向分子对接软件预测虫草素和三磷酸虫草素的靶标蛋白(药效团匹配蛋白),用Ledock分子对接软件模拟虫草素、三磷酸虫草素与靶标蛋白的结合构象,用LigPlus软件分析结合构象活性口袋内残基与配体的相互作用.反向分子对接结果表明:三磷酸虫草素与靶标蛋白的自由结合能比虫草素与靶标蛋白的自由结合能低.分子对接结果表明:与虫草素相比,三磷酸虫草素与靶标蛋白活性口袋内的氨基酸残基可形成更多的氢键,且三磷酸虫草素和靶标蛋白有较好的几何匹配,其自由结合能也较低,其结合构象更稳定.根据正向、反向分子对接结果,认为三磷酸虫草素是虫草素进入人体内发挥生物活性的主要物质.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马玲	东北林业大学林学院	102	944	13.0	27.0
2	张星耀	中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所	81	1638	22.0	37.0
3	张国财	东北林业大学林学院	88	359	10.0	15.0
4	程功	东北林业大学林学院	4	14	2.0	3.0
6	田树新		8	72	3.0	8.0