锦鲤疱疹病毒ORF72基因克隆及结构功能分析

• 作者: 孙志鹏 李池陶 王世会 石连玉 贾智英
• 来源期刊: 水产学杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 锦鲤疱疹病毒 ORF72基因 结构功能分析
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 9-15
• 页数: 7页
• 分类号: S917
• 字数: 4447字
• 语种: 中文

摘要

于辽宁丹东采集感染锦鲤疱疹病毒的活鲤Cyprinus carpio样品,经DNA提取、PCR扩增、重组质粒构建步骤成功克隆锦鲤疱疹病毒ORF72基因,并利用生物信息学软件分析ORF72蛋白结构与功能,构建系统进化树.结果显示:ORF72基因开放阅读框共1113bp,编码蛋白由370个氨基酸组成,理论相对分子质量为40.5KD;ORF72蛋白主要由α螺旋、β折叠、无规则卷曲3种二级结构组成;N端35个氨基酸序列为信号肽序列.跨膜结构分析表明:ORF72蛋白无跨膜区,保守结构域预测表明ORF72含有一个保守结构域,抗原表位分析表明,抗原性较好.结构预测显示:ORF72氨基酸序列存在2个潜在的N-糖基化位点、1个潜在的O-糖基化位点、19个潜在的磷酸化位点.系统进化树分析发现,其与锦鲤疱疹病毒美国株、以色列株属同一分支.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贾智英	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	40	388	10.0	18.0
2	李池陶	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	74	641	14.0	20.0
3	石连玉	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	63	496	13.0	18.0
4	孙志鹏	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	5	7	2.0	2.0
5	王世会	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	5	3	1.0	1.0