iTRAQ技术筛选人黑素瘤A375细胞系let-7a靶标蛋白

• 作者: 周晓伟 孙建方 张倩 方方 王焱 王震英
• 来源期刊: 中华皮肤科杂志
• 关键词: 黑色素瘤 细胞系,肿瘤 微RNAs 蛋白质组学 iTRAQ
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 342-347
• 页数: 6页
• 字数: 5152字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0412-4030.2016.05.011

摘要

目的 同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术在人黑素瘤A375细胞系中筛选let-7a潜在的靶标蛋白,探讨let-7a的抑癌机制.方法 100 nmol/L let-7a模拟物及其对照转染A375细胞,提取细胞总蛋白,运用同位素标记的iTRAQ技术分析和鉴定差异表达的蛋白质,运用生物信息学分析let-7a靶标蛋白及其功能,采用双荧光素酶报告系统验证靶标.结果 let-7a模拟物组和对照组相比,质谱共分析鉴定到327个显著差异蛋白,其中表达量上调＞1.2倍的蛋白有151种,下调＜0.8倍的蛋白有176种.下调的176种蛋白中,软件预测到结合靶标有47个,双荧光素酶报告系统验证表明,let-Ta模拟物组与对照组相比,HMGA2和THOC2野生型3'UTR比值分别降低64.3％和46.4％.结论 iTRAQ技术和生物信息学方法在人黑素瘤A375细胞系中筛选出47个let-7a候选靶标蛋白,其中HMGA2和THOC2分别为let-7a的靶标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方方	中国医学科学院北京协和医学院皮肤病研究所江苏省皮肤病与性病分子生物学重点实验室皮肤外科	56	177	6.0	11.0
2	王焱	中国医学科学院北京协和医学院皮肤病研究所江苏省皮肤病与性病分子生物学重点实验室皮肤外科	49	206	8.0	13.0
3	张倩	中国医学科学院北京协和医学院皮肤病研究所江苏省皮肤病与性病分子生物学重点实验室皮肤外科	30	108	5.0	8.0
4	王震英	山东大学附属省立医院皮肤科	14	35	3.0	5.0
5	周晓伟	中国医学科学院北京协和医学院皮肤病研究所中心实验室	8	8	2.0	2.0