云南黑山羊全基因组重测序

• 作者: 兰蓉 朱兰 洪琼花 邵庆勇
• 来源期刊: 草食家畜
• 关键词: 云南黑山羊 全基因组重测序 单核苷酸多态性 小片段插入缺失变异 结构变异
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 11-17
• 页数: 7页
• 分类号: S813.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.16863/j.cnki.1003-6377.2016.05.003

摘要

采用Illumina Hiseq2000测序技术对由云南黑山羊具有代表性的个体构建的DNA池进行20X全基因组重测序,以期对云南黑山羊分子特征做出评价,并为云南黑山羊功能基因定位提供分子基础数据.结果表明:云南黑山羊可以检测到7 615 774个SNP、877 232个INDEL和40 005个SV.通过比对山羊参考基因组,并进行生物信息学分析,结果显示云南黑山羊位于外显子区域的SNP有35 902个,其中异义突变17 160个,同义突变18 920个;外显子区域的小INDEL有1 330个;位于内含子区域的SNP 1 695 420个,小INDEL 208 999,位于UTR3区域的SNP 16 106个,小INDEL 580个.研究结果基本阐明了云南黑山羊的分子特征,为后续功能基因的研究提供了强大的数据支撑,并为功能基因的定位提供新的思路和线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	兰蓉		20	91	5.0	9.0
2	朱兰		20	42	4.0	6.0
3	洪琼花		124	407	10.0	14.0
4	邵庆勇		93	240	8.0	11.0