基于线粒体COI序列探讨安徽长江流域黄鳝群体遗传分化

• 作者: 凌俊 段国庆 江河 潘庭双 胡玉婷
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄鳝 COI条形码 遗传分化 长江
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 74-80
• 页数: 7页
• 分类号: S917.4|Q347
• 字数: 4533字
• 语种: 中文

摘要

探讨安徽长江流域黄鳝群体遗传结构,采用线粒体COI的DNA条形码序列研究该区6个黄鳝野生群体(当涂、无为、繁昌、贵池、怀宁和望江)遗传分化.180个样本COI片段(665bp)中共检出52个变异位点(变异率7.8％)、40种单倍型.序列中A、T、G、C碱基平均含量分别为24.7％、28.2％、17.1％、30.0％,A+T含量大于G+C含量.AMOVA分析中,高达68.45％遗传变异来自群体间,说明黄鳝群体间已产生显著遗传分化.群体间系统进化树显示:6个群体形成两大类群(当涂和繁昌群体为一类群,其余群体为另一类群),分析表明结果与各群体地理位置密切相关.同时由NCBI下载合鳃鱼科几个物种的COI同源序列,构建系统进化树,显示黄鳝与同属的山黄鳝聚为一支,并与不同属的合鳃鱼和穴栖蛇胸鳝聚为一支.研究表明,基于C0I的DNA条形码序列适于黄鳝群体遗传结构研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘庭双	安徽省农业科学院水产研究所	64	208	7.0	10.0
2	江河	安徽省农业科学院水产研究所	93	401	12.0	16.0
3	凌俊	安徽省农业科学院水产研究所	45	117	6.0	8.0
4	段国庆	安徽省农业科学院水产研究所	46	90	5.0	6.0
5	胡玉婷	安徽省农业科学院水产研究所	38	76	5.0	6.0