2个野扁桃自交不亲和S-RNase基因全长的克隆与序列分析

• 作者: 关鹏 曾斌 李伟阳 李疆 李鹏 王建友 田嘉 罗淑萍
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 野扁桃 自交不亲和性 S-RNase基因 生物信息学 RACE
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 905-916
• 页数: 12页
• 分类号: S662.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20150520

摘要

[目的]克隆新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schlecht.)自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因S-RNase全长序列,为自交不亲和性的分子调控奠定基础.[方法]以新疆野扁桃花柱为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆S-RNase基因全长,采用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、ProtParam、Tmpred、SignalP、Tar-getP、SOPMA、DANMAN、MEGA6和ProtFun对推导的氨基酸序列进行分析.[结果]克隆到PtS16-RNase基因和PtS17-RNase基因,2者均属于RNase T2基因家族,与其他多种植物的S-RNase基因的序列相似度为83％～98％,序列均具有S-RNas蛋白典型结构.PtS16-RNase基因ORF长690 bp,编码229个氨基酸,PtS1 7-RNase基因ORF长678 bp,编码225个氨基酸.预测2个S-RNase蛋白均为亲水性、不稳定的分泌蛋白,二级结构均以α-螺旋、延伸链和无规卷曲为主,在蔷薇科李属植物中具有较高的系统进化一致性,可能的主要功能为水解酶和激素.[结论]获得2个新疆野扁桃自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因S-RNase全长序列.