GyrB基因在诺卡菌菌种鉴定中的应用研究

• 作者: 李振军 李路茜 楼永良
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 诺卡菌 gyrB基因 鉴定
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 503-506
• 分类号: R378
• 语种: 中文
• DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2016.06.014

摘要

目的 分析研究gyrB基因对于诺卡菌种水平的鉴定能力.方法 采用特异性引物对14种41株诺卡菌的gyrB基因进行扩增,并对其产物进行测序.从GenBank数据库中下载21株诺卡菌gyrB基因序列,对序列用DNAStar软件计算其相似性.利用Mega 6.06软件,采用邻接法和最大似然法构建诺卡菌菌种系统发育进化树.结果 以gyrB基因构建的系统发育进化树中,不同诺卡菌种能准确地分离成独立的分支,且亲缘关系较近的近缘种也能得到有效分离.诺卡菌种gyrB基因种内相似性为94.2％ ～ 100％,种间相似性约为79.2％ ～ 97.6％,平均相似性为86.9％.结论 gyrB基因序列分析是一种快速、准确、特异性较高的鉴定方法,能将诺卡菌属的鉴定至种的水平,对于鉴定诺卡菌属近缘种gyrB基因比16SrDNA更具优越性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	楼永良	温州医科大学检验医学院检验医学教育部重点实验室	27	76	5.0	7.0