A genome-wide analysis of theASYMMETRIC LEAVES2/LATERAL ORGAN BOUNDARIES (AS2/LOB) gene family in barley (Hordeum vulgare L.)

• 来源期刊: 浙江大学学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）
• 学科: 农学
• 关键词: 大麦 AS2/LOB基因家族 进化树 表达模式
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 页码范围: 763-774
• 页数: 12页
• 分类号: S512.3
• 语种: 英文

摘要

中文概要题目：大麦ASYMMETRIC LEAVES2/LATERAL OR-GAN BOUNDARIES（AS2/LOB）基因家族的全基因组分析目的：从大麦全基因组中鉴定AS2/LOB基因家族，并进行基因进化、基因结构、染色体定位以及组织、表达分析，为大麦ASL/LBD基因进一步功能研究与鉴定奠定基础。创新点：首次在大麦全基因组水平上分析AS2/LOB基因家族，并对部分基因的功能进行预测和分析。方法：利用大麦基因组数据库，通过生物信息学手段，鉴定大麦AS2/LOB基因家族成员；采用MEGA6软件进行系统进化树分析；利用 GSDS 及MapDraw工具进行基因结构及染色体定位分析；利用已有的大麦RNAseq数据进行组织表达谱分析。结论：通过全基因组分析，大麦AS2/LOB家族基因包括24个成员，在进化上分为两大类，7个亚家族，分布于大麦7条染色体上，组织表达模式具有多样性，与已经报道的ASL/LBD基因具有良好的同源性。这些信息为大麦AS2/LOB基因家族的功能分析奠定了基础。