基于RACE方法的草莓Faapx-c基因克隆、表达及其生物信息学分析

• 作者: 侯艳霞 张勇 林源秀 汤浩茹 郭艳 陈清
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓 Faapx-c基因 RACE 克隆 表达 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 88-92
• 分类号: S668.403.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.11937/bfyy.201611023

摘要

以草莓栽培品种“丰香”为试材,利用RT-PCR和3′-RACE技术克隆胞质抗坏血酸过氧化物酶基因Faapx-c,并对其进行了生物信息学分析.结果表明:Faapx-c基因长1 034 bp,所编码的蛋白FaAPX-c是一个结构稳定、亲水性、非分泌型的蛋白质,其二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲2种形式出现,具有可靠的三维结构,属于植物过氧化物酶家族.Faapx-c基因在草莓的根、茎和叶中能被低温诱导,表达量先升高后下降,而在花中的表达随低温时间的延长而消失.该研究为进一步进行Faapx-c基因的功能研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汤浩茹	四川农业大学园艺学院	150	2302	23.0	42.0
2	张勇	四川农业大学园艺学院	50	712	12.0	26.0
3	陈清	四川农业大学园艺学院	45	318	9.0	17.0
4	林源秀	四川农业大学园艺学院	7	21	3.0	4.0
5	侯艳霞	山西林业职业技术学院园艺系	26	38	3.0	5.0
6	郭艳	山西林业职业技术学院园艺系	12	138	4.0	11.0