罗氏沼虾Rab11基因cDNA克隆及其组织表达分析

• 作者: 夏正龙 彭菲 慎佩晶 杨国梁 濮剑威 陈雪峰 高强 黄振远 黄雪娜
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 罗氏沼虾 Rab11 组织表达 免疫应答
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 页码范围: 443-450
• 页数: 8页
• 分类号: Q344+.1
• 字数: 5424字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2016.59

摘要

为了发掘罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)免疫相关基因,研究Rab蛋白(Ras-related proteins in brain)在罗氏沼虾免疫应答中发挥的作用,研究采用RACE-PCR技术克隆了罗氏沼虾Rab11基因全长cDNA序列,记为rRab11.全长1381bp,包括226bp的5'UTR,511 bp的3'UTR和645bp的开放阅读框,编码214个氨基酸,含有一个Rab结构域.氨基酸序列比对显示,罗氏沼虾与冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)、蚤状溞(Daphnia pulex)、叶蝉(Homalodisca vitripennis) Rab1 1-致性分别为82％、83％和82％.软件预测,MrRabl1编码的蛋白分子量约为23.75kD,等电点约为5.34.实时荧光定量表达分析表明,MrRab11基因在罗氏沼虾各组织中都有表达,肝胰腺中的表达量最高,其次是肌肉和肠道.在阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)感染12h后,罗氏沼虾肝胰腺中MrRab11的表达量上升,显著高于对照组(P＜0.05),推测这是MrRab11对阴沟肠杆菌的应激表达,MrRab11在肝胰腺中参与了罗氏沼虾免疫应答过程.