仁用杏花芽3个发育时期转录组表达谱研究

• 作者: 乌云塔娜 姜仲茂 宋猜 李慧
• 来源期刊: 经济林研究
• 学科: 农学
• 关键词: 仁用杏 花期 转录组分析 数字基因表达谱 开花途径
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 14-19
• 页数: 6页
• 分类号: S662.2
• 字数: 4347字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14067/j.cnki.1003-8981.2016.04.003

摘要

为给仁用杏分子育种提供理论依据，培育仁用杏晚花新品种，通过Illumina HiSeqTM2000高通量测序——转录组测序（RNA-seq）技术，对采于花芽萌动前后3个发育时期的仁用杏花芽进行转录组测序。经组装分析获得43469条unigenes；将所得到的unigenes与基因库数据进行比较，对unigenes进行功能注释，共22874条unigenes获得功能注释，并预测出21910条unigenes蛋白编码区；将3个发育时期仁用杏花芽的花转录组通过GO功能分类，将17237条unigenes分别归类为46个GO Term；通过将所有unigenes与KOG数据库比对，共有8379条unigenes与其它植物相似，归为26类，未知功能的unigenes有409条，预测这些基因为仁用杏的新基因；通过与KEGG数据库比对，共获得6203条unigenes，参与259个代谢途径，其中与植物节律代谢通路相关的unigenes有33条。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	乌云塔娜	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	64	476	10.0	18.0
2	李慧	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	5	11	3.0	3.0
3	宋猜	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	5	18	3.0	4.0
4	姜仲茂	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	13	46	4.0	6.0