犬圆环病毒全基因组克隆与序列分析

• 作者: 何杰勇 孙文超 张红云 徐素萍 曹慧慧 苏姣秀 郑敏 韦显凯
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 农学
• 关键词: 犬圆环病毒 基因 进化分析
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 429-435
• 页数: 7页
• 分类号: S852.65+5
• 语种: 中文

摘要

犬圆环病毒(Dog circovirus,DogCV)是近年来新发现的一种哺乳动物圆环病毒.为研究DogCV中国流行毒株基因组特性和遗传进化,以犬血清样品提取的DNA为模板,采用重叠PCR技术首次获得DogCV中国流行毒株的全基因组序列,命名为JZ98/2014.序列分析表明JZ98/2014全基因组长度为2063nt,编码3个主要开放阅读框:ORF V1(Rep蛋白,303个氨基酸)、ORF C1(Cap蛋白,270个氨基酸)和ORF C2(106个氨基酸).同源性比较显示JZ98/2014与美国、欧洲流行毒株的全基因组序列同源性为82.1 ％-89.5％,而Rep和Cap基因同源性分别为82.1％-89.5％和84.6％-89.1％.遗传进化树分析显示,目前世界流行的DogCV存在多个分支,而JZ98/2014与美国、欧洲流行毒株处于不同分支.