DNA双链区的切割导致碱变性超螺旋质粒pBR322的分子内结节

• 作者: 张臻峰 田磊 苏小运 黄熙泰
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 关键词: DNA Ⅳ 限制性内切酶 DNA拓扑异构酶 DNA结节 原子力显微镜
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 778-786
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16476/j.pibb.2015.0160

摘要

为进一步研究碱变性超螺旋DNA(Ⅳ型DNA;DNA Ⅳ)的结构,对碱变性质粒pBR322进行了酶学分析并利用原子力显微镜(AFM)对新形成的DNA结构进行了观察和比较.在所有已检测的限制酶中只有Pst Ⅰ可以切割质粒pBR322的Ⅳ型DNA分子,说明在这种变性的DNA分子中仍存在少数完整的限制酶识别位点.与碱变性DNA分子的闭合环状结构相反,AFM成像的结果显示Pst Ⅰ处理后的DNAⅣ分子均为开放结构,同时这种分子包含明显的DNA结节.与DNAⅣ分子相比,这种DNA分子的表观长度缩短了大约11％.有意思的是,大肠杆菌拓扑异构酶Ⅳ(一种Ⅱ型拓扑异构酶)也可以在pBR322 DNAⅣ分子中引入分子内结节,而这种结节DNA分子仍然保持闭合状态.AFM的结果表明上述两种结节的DNA分子在表观长度及结节结构的尺寸上均比较相似.这些发现证实,在碱变性的超螺旋DNA分子中仍然保留着一些长度较短的、含有特异性碱基配对的DNA双链区,而在这些区域内的DNA双链断裂可以导致DNA结节.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄熙泰		16	84	4.0	9.0
2	田磊		14	57	4.0	7.0
3	苏小运	中国农业科学院饲料研究所	7	7	2.0	2.0
4	张臻峰	中国科学院微生物研究所	2	0	0.0	0.0