虾虎鱼科（Gobiidae）基因组微卫星 DNA 的分布特征

• 作者: 庄志猛 柳淑芳 白翠翠
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 虾虎鱼科 微卫星 基因组
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 9-15
• 页数: 7页
• 分类号: S917.4
• 字数: 5334字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11758/yykxjz.20151008001

摘要

为了解虾虎鱼科(Gobiidae)鱼类基因组遗传结构特征，本研究自主开发矛尾复虾虎鱼(Synechogobius hasta)微卫星序列153条，结合从 GenBank 中筛选出的虾虎鱼科微卫星序列535条，合计686条微卫星序列，隶属于19种虾虎鱼，序列总长度为295062 bp，包含473个微卫星位点，微卫星位点累计长度为33370 bp。统计微卫星重复类型，发现在所有微卫星重复类型中以二碱基重复出现次数最多，位点数为361个，占总微卫星的76.32%，其中，重复拷贝类别最多的是 AC (340个)，占全部微卫星的71.88%，占二碱基重复微卫星的94.18%，在二碱基重复类型中没有发现 AT 和 GC 两种重复类型。三碱基重复位点数为35个，占总微卫星的7.4%，其中以 ACT 重复拷贝类别最多(12个)，占三碱基重复微卫星的34.29%。四碱基重复位点数为68个，其中以 CTAT 重复最多(31个)，占总微卫星的14.38%。五碱基重复类型中只有 TCTGG和 ATCTA 两种类型，只占全部微卫星的0.42%。六碱基重复7个，占总微卫星的1.48%，六碱基重复中各重复类型出现次数相当。在所有微卫星重复类型中没有发现单核苷酸重复类型。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柳淑芳	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	4	32	3.0	4.0
5	白翠翠	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	3	8	1.0	2.0