瓯江彩鲤酪氨酸酶(TYR)基因的选择压力分析

• 作者: 古珍珍 徐志彬 杨新鑫 王军 王剑 王成辉 胡建尊 项松平
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 瓯江彩鲤 酪氨酸酶基因 选择压力 遗传变异
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 329-336
• 分类号: S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.12024/jsou.20150901537

摘要

酪氨酸酶是生物体黑色素合成的关键限速酶,黑色斑纹是瓯江彩鲤(Cyprinus carpio var.color)体色的主要特点之一.以瓯江彩鲤的5种体色选育系F5为材料,探讨酪氨酸酶基因5个外显子及其在不同体色间的变异特性和承受选择压力的敏感性.结果发现:酪氨酸酶基因外显子1和外显子5的核苷酸变异率最高,选择性位点最多,易承受到选择压力;5个外显子的非同义替换率(dN)与同义替换率(ds)的比值(ω值)均小于1 (0.10～0.67),表明它们均受到净化选择压力;不同体色瓯江彩鲤的酪氨酸酶基因也均受到净化选择压力(ω=0.12 ～0.23).应用PAML软件中的M2a和M8两种模型检测显示:无黑斑体色瓯江彩鲤所受正向选择压力位点数高于有黑斑体色,但不存在显著差异(P＞0.05);酪氨酸酶基因中的部分氨基酸位点较易受正向选择压力.研究结果表明:瓯江彩鲤酪氨酸酶基因较保守,主要受净化选择作用,当前的人工选育未对酪氨酸酶基因造成显著的选择压力.