牦牛和普通牛 DRB1* Intron 1-exon 2序列变异分析

• 作者: 刘秀 李少斌 牟永娟 田知利 罗玉柱 胡江 郭淑珍 陈杰
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 牦牛 普通牛 DRB1 基因 Intron 1 Exon 2 多态性
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 页码范围: 72-79
• 页数: 8页
• 分类号: Q78
• 字数: 5219字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2016.03.011

摘要

为揭示牦牛抗逆性及抗病育种积累更多的分子遗传学资料，通过检测 DRB1基因在牦牛和普通牛群体中的变异，分析该基因检测区域遗传参数。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛和普通牛为研究对象。应用PCR-SSCP 方法检测 BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子部分序列多态性。DRB1基因第1内含子区检测到4处 SNPs 及1处插入／缺失突变，第2外显子区检测到17处 SNPs，两区域均表现为高度多态；单倍型连锁分析发现21种 intron 1-exon 2单倍型组型且存在单倍型连锁不平衡现象，A-A 1、A-B 1、B-A 1和 B-B 1单倍型在牦牛和普通牛中频率较高；聚类分析表明，牦牛 DRB1基因第2外显子区碱基序列与普通牛及山羊的同源性最高，系统进化情况与它们亲缘关系远近一致。牦牛和普通牛 BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子多态性丰富，可作为牦牛和普通牛 BoLA-DRB1的遗传标记。