巨(魾)细胞色素氧化酶基因多态性及系统进化研究

• 作者: 刘艳红 杜民 牛宝珍 王婷婷 艾加林
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 巨(魾) CO Ⅰ CO Ⅱ CO Ⅲ 序列分析 系统发育
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 337-343
• 分类号: S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.12024/jsou.20150701515

摘要

采用PCR技术克隆得到12尾巨(魾)(Bagarius yarrelli)的细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)、细胞色素氧化酶Ⅱ(COⅡ)和细胞色素氧化酶Ⅲ(COⅢ)的基因序列.结果显示:巨(魾)CO Ⅰ基因序列全长1 551 bp,12个个体共出现9个单倍型,13个突变位点;COⅡ基因序列全长691 bp,12个个体共出现5个单倍型,5个突变位点;COⅢ基因序列全长784 bp,12个个体出现7个单倍型,8个突变位点.通过最小进化法Minimum Evolution (ME)构建系统发育树分析显示,巨(魾)与14种鱿科鱼在序列上有一定的同源性,并且CO Ⅰ、COⅡ和COⅢ都与中华纹胸姚(Glyptothorax sinense)、福建纹胸鱿(Glyptothorax fukiensis)、三线纹胸鱿(Glyptothorax trilineatus)和长丝黑鱿(Gagata dolichonema)在同一个分支,表明巨(魾)与纹胸鱿属和黑跳属有较近的亲缘关系.