基于18S rDNA遗传距离与GC含量对游走类纤毛虫的分子系统学研究

• 作者: 唐发辉 赵元莙
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 系统发生 18S rDNA 车轮虫属 小车轮虫属 GC含量 遗传距离
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 页码范围: 358-369
• 页数: 12页
• 分类号: Q959.116
• 字数: 2792字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2016.48

摘要

为了揭示游走类纤毛虫的系统发生,对寄生于淡水鱼类的车轮虫科中的6种车轮虫进行了18S rDNA的测序并获得了9个序列.采用了最大似然法(ML)与贝叶斯法(BI)对GenBank中所有游走类纤毛虫的18S rDNA序列进行了系统树的构建,并首次将SPSS与18S rDNA遗传距离结合分析了游走类纤毛虫的系统发生.研究结果进一步证实了车轮虫属(Trichodina)的非单系发生与小车轮虫属(Trichodinella)的有效性.此外,研究结合18S rDNA的GC含量与遗传距离分析提出了游走类纤毛虫科属及种间新的鉴定依据:18S rDNA的GC含量可用于游走类纤毛虫的科属区分,且与游走类纤毛虫的分化密切相关;18S rDNA的遗传距离在游走类纤毛虫的不同阶元中具有一定的阈值范围,即通常种内遗传距离阈值范围为0.000-0.005,属种间阈值范围为0.005-0.150,当遗传距离大于0.150时,则达到了科间水平.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵元莙	重庆师范大学重庆师范大学动物生物学重点实验室	54	259	10.0	13.0
2	唐发辉	重庆师范大学重庆师范大学动物生物学重点实验室	25	130	6.0	10.0