水稻草矮病毒侵染的水稻根系差异蛋白鉴定

• 作者: 丁新伦 吴祖建 张洁 谢荔岩
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻草矮病毒 水稻根系 差异表达蛋白 双向荧光差异凝胶电泳 基质辅助激光解析串联飞行时间质谱技术
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 356-362
• 页数: 7页
• 分类号: S435.111.4|S511.034
• 字数: 4828字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16819/j.1001-7216.2016.5193

摘要

为鉴定与水稻草矮病毒(Rice grassy stunt virus,RGSV)侵染引起的水稻根系发育不良的相关蛋白,解析根系发育不良症状的形成机理以及水稻草矮病毒与水稻互作的分子机制,采用双向荧光差异凝胶电泳(2 D-DIGE)结合基质辅助激光解析串联飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)对 RGSV侵染水稻后根系的差异表达蛋白进行分离和鉴定,并对鉴定的差异表达蛋白进行 GO聚类分析和 KEGG生物通路注释.结果表明,差异倍数大于2的蛋白质点有56个,其中,表达丰度升高的点有34个,表达丰度下降的点有22个；质谱成功鉴定出27个蛋白质点,分属于25种蛋白质.GO聚类分析表明差异表达蛋白涉及14个生物学过程,在生物功能上分属10类.细胞组件分析显示差异表达蛋白定位于不同的细胞部位.KEGG通路分析显示差异蛋白参与了12个生物通路.