基于高通量测序的沼泽山雀简化基因组微卫星位点的开发

• 作者: 万冬梅 何雨昕 李成安 韩梅
• 来源期刊: 辽宁大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 沼泽山雀 微卫星 高通量测序 简化基因组
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 生命与环境科学
• 页码范围: 252-257
• 页数: 6页
• 分类号: Q953+.5
• 字数: 3215字
• 语种: 中文

摘要

沼泽山雀是一种广域分布物种,目前关于该物种的微卫星位点信息较少.高通量测序技术因其获得微卫星序列更加低廉、高效而逐渐被用于微卫星筛选当中.实验选取Illumina MiSeq高通量测序平台对沼泽山雀简化基因组进行了测序,共得到2.84M读长,共开发113 519个SLAF标签;利用MISA对所得的112 558条有效序列进行微卫星片段搜索,最终成功搜索出2 471个微卫星位点,总分布密度为870.07个/M.大量的微卫星位点为微卫星的进一步筛选提供了丰富的材料,有利于沼泽山雀后续遗传学水平方面的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	万冬梅	辽宁大学生命科学院辽宁省动物资源与疫病防治重点实验室	60	535	11.0	20.0
2	李成安	辽宁大学生命科学院辽宁省动物资源与疫病防治重点实验室	2	8	2.0	2.0
3	韩梅	辽宁大学生命科学院辽宁省动物资源与疫病防治重点实验室	2	8	2.0	2.0
4	何雨昕	辽宁大学生命科学院辽宁省动物资源与疫病防治重点实验室	1	6	1.0	1.0