南移池塘养殖仿刺参肠道菌群结构分析

• 作者: 何丽斌 周宸 杜虹 杨求华 林琪 葛辉 陆振 黄瑞芳
• 来源期刊: 渔业研究
• 学科: 农学
• 关键词: MiSeq高通量测序 仿刺参 池塘养殖 肠道菌群
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 论文与报告
• 页码范围: 192-201
• 页数: 10页
• 分类号: S917.4
• 字数: 4242字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14012/j.cnki.fjsc.2016.03.003

摘要

本文基于MiSeq高通量测序技术对南移福建池塘养殖仿刺参(Apostichopus japonicus)肠道菌落结构进行分析.结果表明,仿刺参前肠(1C_1)、中肠(1C_2)和后肠(1C_3)测得的分类操作单元(OTUs)分别为424、444和414;三组样品的菌群物种丰度没有较大差别,但优势菌种存在较大差异;优势菌群方面,后肠的优势菌群为Haliea属和乳球菌属(Lactococcus)(分别占后肠总菌数的11.97％和10.37％),而前肠和中肠的优势菌群均是乳球菌属和芽孢杆菌属(Bacillus),两者在前肠菌落中的占比分别为27.91％和6.08％,在中肠中的占比分别为33.24％和6.97％.在重复性方面,三组样品的菌落组成都有重叠,重叠率为74.35％,其中前肠与中肠相似度较高,菌株种类有90％以上重叠.本文研究为仿刺参肠道益生菌的开发利用提供基础资料.