杧果FPPS基因的鉴定和序列分析

• 作者: 党志国 朱敏 王鹏 盖江涛 陈华蕊 陈振玺
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 杧果 萜类 法尼基焦磷酸合成酶 系统进化 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 园艺林学
• 页码范围: 69-75,封2
• 页数: 8页
• 分类号: S667.7|Q37
• 字数: 5351字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2016.06.013

摘要

法尼基焦磷酸合成酶(Farnesyl Pyrophosphate Synthase,FPPS,EC:2.5.1.1)是倍半萜合成中的一个关键酶,在植物萜类合成过程中有关键作用.以杧果FPPS基因为研究对象,以拟南芥FPPS基因为参考,通过BLAST方法从番木瓜、金钱橘、甜橙、苹果、小果野蕉、桃子、白梨、葡萄、中华猕猴桃、无油樟基因组数据中获得了FPPS基因,共19条FPPS基因序列,对其进行了系统进化分析和生物信息学分析.系统进化结果显示:双子叶植物纲果树与单子叶植物纲果树关系较远,同是双子叶植物纲的果树关系较近,同科果树亲缘关系更近.生物信息学分析结果显示:氨基酸序列中,酸性蛋白占94.7％,稳定性蛋白占84.2％,有信号肽的蛋白占5.3％,有导肽的蛋白占10.5％,所有蛋白均为有明显跨膜现象的亲水性蛋白;所有FPPS基因亚细胞定位于线粒体中,均有蛋白活性位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱敏	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	25	202	7.0	13.0
2	王鹏	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	18	24	4.0	4.0
3	陈华蕊	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	17	69	5.0	7.0
4	盖江涛	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	14	28	4.0	5.0
5	党志国	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	11	13	2.0	3.0
6	陈振玺	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	3	12	2.0	3.0