基因组水平预测稻瘟菌分泌蛋白组及富集分析

• 作者: 刘俊 曹继东 李遂焰
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 稻瘟菌 分泌蛋白组 分泌蛋白 糖代谢
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 129-138
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.08.020

摘要

稻瘟菌分泌蛋白在稻瘟菌入侵植物过程中发挥着重要的作用。这些分泌蛋白中有很多是效应蛋白，这些效应蛋白可以干扰寄主的抗性、抑制寄主免疫反应。因此，对稻瘟菌分泌蛋白组的预测及功能分析就显得十分必要，也是目前植物和微生物分子互作研究领域的热点。使用 SignalP、TMHMM 及 SecretomeP 等软件，完成稻瘟菌分泌蛋白组的预测。同时，对含信号肽的经典分泌蛋白进行了 GO 功能富集、KEGG 通路分析、结构域统计以及可降解植物成分的经典分泌蛋白预测等分析。结果显示，稻瘟菌含有约789个分泌蛋白，其长度多集中在100-500 aa ；GO 功能分析发现，这些分泌蛋白多富集在分泌途径及宿主互作中；KEGG 分析显示，分泌蛋白在糖代谢途径中发挥着重要作用；大规模筛选预测到156个分泌蛋白具有降解植物细胞壁等成分的功能；同时还发现稻瘟菌中有可能存在大量不含信号肽的非经典分泌蛋白。通过设计的生物信息学流程，实现了稻瘟菌分泌蛋白组的预测；预测出经典分泌蛋白具有可降解植物细胞壁等成分以及参与糖代谢途径的功能；稻瘟菌中存在大量的无信号肽的非经典分泌蛋白。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘俊	中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室	91	716	13.0	23.0
2	曹继东	西南交通大学生命科学与工程学院	8	58	4.0	7.0
4	李遂焰	西南交通大学生命科学与工程学院	15	36	4.0	5.0