基于GO体系的基因功能相似性度量方法

• 作者: 张树波 赖剑煌
• 来源期刊: 计算机应用与软件
• 学科: 工学
• 关键词: 基因本体 GO术语 语义相似性 功能相似性 最短路径 信息量
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 应用技术与研究
• 页码范围: 31-37
• 页数: 7页
• 分类号: TP3-05
• 字数: 10162字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-386x.2016.01.009

摘要

比较基因或基因产物功能上的相似性是生命科学研究的一项重要内容,它在生物大分子功能预测、基因聚类、生物网络分析和疾病相关基因筛选等方面具有广泛的应用.计算基因之间的功能相似性已经成为生物信息学研究的基础性工作.基因本体GO(Gene Ontology)体系集成了多种异质数据库的信息,用结构化的自然语言术语对基因和基因产物的功能进行注释和分类,是研究基因功能相似性的有力工具.从GO术语之间相似性、基因之间功能相似性两个方面,总结和评述过去十几年里,人类利用生物信息学方法在语义水平上研究基因功能相似性的进展和取得的成果,分析基因功能相似性计算方法存在的问题和面临的挑战,指出基于GO体系的基因功能相似性度量方法今后的主要研究方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖剑煌	中山大学信息技术与科学学院	41	804	15.0	28.0
5	张树波		5	91	3.0	5.0