海蜇(Rhopilema esculentum)磷脂酶A2基因的cDNA、基因组克隆与表达分析

• 作者: 周春娅 庄志猛 朱玲 杨洪 骆晓蕊
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 海蜇 磷脂酶A2 cDNA 基因组 表达分析
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 123-130
• 页数: 8页
• 分类号: Q346
• 字数: 4483字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11758/yykxjz.20150521002

摘要

本研究利用RACE和RT-PCR技术克隆了海蜇(Rhopilema esculentum)磷脂酶A2基因(Re-PLA2-1)的cDNA及基因组序列,并分析了其mRNA在海蜇不同发育阶段的表达.Re-PLA2-1基因的cDNA全长为824 bp,包括了48 bp的5'非编码区、504 bp的开放阅读框及272 bp的3'非翻译区.SMART分析显示,Re-PLA2-1为分泌蛋白,包括了一个由19个氨基酸组成的信号肽和一个由118个氨基酸组成的磷脂酶A2结构域.多序列比对和系统进化分析显示,Re-PLA2-1基因与来自星状海葵(Nematostella vectensis)、僧袍芋螺(Conus magus)、长牡蛎(Crassostrea gigas)等磷脂酶A2的相似性较高,共同聚类为pfam09056 GIX PLA2分支,均包含pfam09056家族成员酶活性所必需的Ca2+结合位点、活性催化位点和PLA2结构域所必需形成二硫键的半胱氨酸.Re-PLA2-1基因组全长为2671 bp,由4个外显子和3个内含子组成.RT-PCR结果显示,Re-PLA2-1基因在海蜇4个发育阶段均有表达,其中,横裂体阶段的表达量最高,碟状体阶段最低.这些研究结果为进一步了解海蜇磷脂酶A2毒素的生物功能奠定了基础.