鲉形目鱼类DNA条形码分析及鲉科DNA条形码电子芯片建立

• 作者: 庄志猛 李献儒 杨善军 杨钰 柳淑芳
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鲉形目 鲉科 DNA条形码 DNA条形码芯片
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1006-1022
• 页数: 17页
• 分类号: S917
• 字数: 5812字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2016.15450

摘要

为建立鲉形目内各物种的快速鉴别方法,本研究扩增了我国47个鲉形目物种并下载了GenBank上收录的鲉形目共计23科85属233种873条细胞色素C氧化酶Ⅰ基因(COI)序列,分析该基因结构特性.结果表明,鲉形目DNA条形码基因的碱基变异中,不变位点508个,占总位点数的82.1％;转换位点70个,颠换位点41个,分别占总位点数的11.3％和6.6％;种内遗传距离为0～0.019,平均遗传距离为0.003±0.0034;属内种间遗传距离为0.003～0.258,平均值为0.086±0.038;基于233个物种的COI序列构建的系统进化树显示,227个物种(97.4％)能聚为独立分支,且具有较高支持度.在此基础上以鲉科11属39种鱼类的DNA条形码为例,筛选出25个种的37个特异性探针,以此探针对鲉科鱼类进行物种快速鉴定成功率为64.1％,研究结果表明DNA条形码芯片用于鲉科的鉴定具有一定的可行性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柳淑芳	中国水产科学研究院黄海水产研究所	17	403	9.0	17.0
3	庄志猛	中国水产科学研究院黄海水产研究所	55	1749	23.0	41.0
6	李献儒	中国水产科学研究院黄海水产研究所	3	10	2.0	3.0
8	杨善军		3	32	3.0	3.0
11	杨钰	中国水产科学研究院黄海水产研究所	2	3	1.0	1.0