马氏珠母贝SNP标记开发及家系遗传多态性分析

• 作者: 何毛贤 刘文广 李耀国 林坚士
• 来源期刊: 海洋通报
• 学科: 农学
• 关键词: 马氏珠母贝 SNP 遗传多态性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 96-102
• 页数: 7页
• 分类号: S968.31
• 字数: 4190字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11840/j.issn.1001-6392.2016.01.013

摘要

利用13个源自转录组序列的SNP标记对3个马氏珠母贝(Pinctadafucata)家系进行遗传多态性分析及聚类分析.结果显示,家系1#、3#、6#的平均期望杂合度(He)分别为0.307 8、0.318 9和0.382 7;平均观测杂合度(Ho)分别为0.342 2、0.341 0和0.394 2;平均多态信息含量(PIC)分别为0.243 5、0.247 9和0.297 7.结果表明,3个马氏珠母贝家系具低度或中度遗传多态性,为马氏珠母贝内SNP应用于遗传多态性分析等提供了基础.利用SNP标记对3个家系进行聚类分析,发现半同胞家系1#和3#在家系及个体聚类中均先聚在一起,然后再与亲缘关系较远的家系6#聚在一起.新开发的SNP标记能较准确地对家系及个体进行聚类,为SNP标记应用于马氏珠母贝遗传关系分析提供了研究基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘文广	中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室	9	119	7.0	9.0
2	林坚士	中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室	10	218	7.0	10.0
3	李耀国	中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室	1	2	1.0	1.0