丙型肝炎病毒相关性肝细胞癌的基因表达分析

• 作者: 孙朝晖 王凤 郑文岭 马文丽
• 来源期刊: 解剖学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 肝细胞癌 生物信息学 基因表达 Qlucore Omics Explorer软件
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 肿瘤生物学
• 页码范围: 67-71
• 分类号: Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.16098/j.issn.0529-1356.2016.01.012

摘要

目的 分析慢性丙型肝炎发展为肝细胞癌(HCC)过程中的差异表达基因谱.方法 以GEO数据库的基因表达谱数据GDS4880、GDS4887为分析材料,采用Qlucore Omics Explorer 3.0软件筛选慢性丙型肝炎与丙型肝炎病毒(HCV)相关性肝细胞癌芯片数据的差异表达基因,结合生物信息学工具PANTHER、DAVID、STRING、Cytoscape对差异表达基因及其相互作用关系进行分析.结果 筛选出共差异表达基因328个,其中上调表达133个,下调表达195个.这些差异表达基因主要涉及代谢过程、生物调节、定位等生物过程,p53信号通路、胰岛素信号通路、磷脂酰肌醇信号系统、细胞凋亡等信号通路.差异表达基因编码蛋白间的相互作用主要集中在14个蛋白质(CYP2B6、CYP2E1、AKT1、CDK16、RELA、CDC27、PIK3CA、GNB1、FOXO1、FYN、PDPK1、SCAND1、SGOL1、RPH3AL).结论 CYP2E1等14个基因可能与HCV相关性肝细胞癌的发生发展相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙朝晖	广州军区广州总医院检验科	99	504	11.0	18.0
2	马文丽	南方医科大学基因工程研究所	275	1255	15.0	23.0
3	郑文岭	南方医科大学基因工程研究所	121	603	11.0	20.0
4	王凤	南方医科大学基因工程研究所	5	36	3.0	5.0