家兔不同发育阶段和组织中内参基因的稳定性分析

• 作者: 文娟 曾婉秋 杨晓农 陈瑞
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 内参基因 表达稳定性 MIQE RefFinder
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 477-483
• 页数: 7页
• 分类号: S829.1|S813.3
• 字数: 4553字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.03.008

摘要

本研究旨在筛选出新西兰白兔不同时期不同器官中表达最稳定的内参基因.以胚胎期(E28.5)、幼龄期(10 d)和成年期(A)3个阶段的新西兰白兔的肾、心和肝3种组织作为研究对象,按照RT-qPCR试验最低要求试验信息量(MIQE)的指导,运用RT-qPCR和在线内参基因稳定性评价工具RefFinder,比较6个常用的内参基因(GAPDH、HPR T1、18S rRNA、B2M、Sdha、-actin)mRNA的表达稳定性.结果表明,新西兰白兔的肝和肾组织中的6个内参基因在3个发育阶段最稳定的3个内参基因依次是β-actin、HPRT1、GAPDH,而在心组织中最稳定的3个内参基因依次是β-actin、HPRT1、Sdha.在新西兰白兔胚胎期的3种组织中,最稳定的3个内参基因依次是GAPDH、-actin、HPRT1,而在幼龄期和成年期最稳定的3个内参基因依次是HPRT1、GAPDH、β-actin.对新西兰白兔的3个发育阶段和3种组织的内参基因稳定性结果分析表明,最稳定的3个内参基因依次是β-actin、HPRT1、GAPDH.本研究证实,新西兰白兔不同的发育时期和组织中,最稳定的内参基因不同.推荐在进行新西兰白兔的相关试验时,可以选择上述表达最稳定的至少3个内参基因的几何平均数作为标准化相关RT-qPCR数据的指标,以确保试验组个体间的差异最小,和小变量的准确数据分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨晓农	西南民族大学生命科学与技术学院	70	300	10.0	14.0
2	文娟	西南民族大学生命科学与技术学院	5	27	3.0	5.0
3	陈瑞	西南民族大学生命科学与技术学院	5	21	2.0	4.0
4	曾婉秋	西南民族大学生命科学与技术学院	2	14	2.0	2.0