全基因组预测枯草芽孢杆菌BEST195的分泌蛋白

• 作者: 任文来 刘通 夏秀芹 韩长志
• 来源期刊: 西南林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 枯草芽孢杆菌 分泌蛋白 信号肽 预测
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 106-111
• 页数: 6页
• 分类号: S759.81
• 字数: 3207字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11929/j.issn.2095-1914.2016.06.017

摘要

枯草芽孢杆菌BEST195作为纳豆菌的一种,是纳豆生产的重要菌株之一.利用SignalP、ProtComp、TMHMM、Phobius、LipoP、TatP等预测程序对该菌中4456条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,同时,对上述分泌蛋白的氨基酸分布、 信号肽长度大小、 信号肽切割位点等性质进行分析.结果表明:枯草芽孢杆菌含有分泌蛋白102个,其氨基酸长度、 信号肽长度与植物病原菌不同;信号肽切割位点属于A-X-A类型,与其他已经报道的植物病原真菌、 细菌以及卵菌中分泌蛋白信号肽切割位点一致.通过上述生物信息学分析方法有效地实现了枯草芽孢杆菌BEST195分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点具有物种保守型特点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩长志	西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室	74	325	9.0	16.0
2	任文来		5	25	3.0	5.0
3	刘通		2	9	1.0	2.0
4	夏秀芹		2	10	1.0	2.0