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水蕨血红蛋白基因的分子克隆和序列分析
水蕨血红蛋白基因的分子克隆和序列分析
作者:
李大卫
葛亚飞
齐小琼
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
植物血红蛋白
序列分析
三级结构模拟
结构进化
水蕨
摘要:
植物血红蛋白(Hemoglobin)是一类由珠蛋白(Globin)和血红素(Ferroheme)组成的结合蛋白,在植物中广泛分布,迄今已在苔藓植物、裸子植物和被子植物中克隆到血红蛋白基因序列,但在蕨类植物中相关研究还未见报道.该研究采用热不对称交错PCR(TAIL-PCR)方法克隆了水蕨血红蛋白基因的全长序列.该基因的序列总长为949 bp,包含4个外显子和3个内含子,编码189个氨基酸.预测的蛋白质(命名为CtHb)的分子量为21.14 kDa,等电点(pI)为7.81.三维结构模拟表明CtHb具有植物血红蛋白典型的三级结构:即含有A、B、C、E、F、G和H螺旋,形成了3-on-3的"三明治"结构.和水稻血红蛋白的三级结构相比,CtHb的大部分结构(包括具有远端和近端组氨酸定位的E螺旋和F螺旋的位置等)同水稻的结构极为相似.两者的不同之处主要表现在:(1)CtHb含有较长的N-端区域;(2)两者CD-loop的折叠方式不同;(3)两者螺旋B和螺旋C的连接方式不同,CtHb是通过卷曲连接的,而水稻中借助的是螺旋.结构进化分析揭示了植物血红蛋白从非共生到共生进化过程中的一些关键改变,这些改变可能有助于非共生血红蛋白向共生血红蛋白结构的转变,特别是有助于豆血红蛋白共生功能的实现.
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篇名
水蕨血红蛋白基因的分子克隆和序列分析
来源期刊
广西植物
学科
生物学
关键词
植物血红蛋白
序列分析
三级结构模拟
结构进化
水蕨
年,卷(期)
2016,(2)
所属期刊栏目
植物生理与发育
研究方向
页码范围
216-223,161
页数
9页
分类号
Q943.2|Q75
字数
6318字
语种
中文
DOI
10.11931/guihaia.gxzw201506023
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李大卫
中国科学院武汉植物园植物种质创新与特色农业重点实验室
10
9
1.0
3.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
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共引文献
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植物血红蛋白
序列分析
三级结构模拟
结构进化
水蕨
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广西植物
主办单位:
广西壮族自治区广西植物研究所
中国科学院广西植物研究所
广西植物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3142
CN:
45-1134/Q
开本:
大16开
出版地:
广西桂林市雁山镇85号广西植物研究所《广西植物》编辑部
邮发代号:
48-43
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
3580
总下载数(次)
1
总被引数(次)
42592
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
湖北省自然科学基金
英文译名:
Natural Science Foundation of Hubei Province
官方网址:
http://www.shiyanhospital.com/my/art/viewarticle.asp?id=79
项目类型:
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学科类型:
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