基于反向对接法的黄连碱抗炎机制分子模拟研究

• 作者: 孟宪丽 张艳 徐佑东 曾勇 王平
• 来源期刊: 中药与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 黄连碱 分子对接 JAK2/STAT3通路 TLR4/NF-κB通路 炎症 AutoDock
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 药理毒理
• 页码范围: 56-60
• 页数: 5页
• 分类号: R285.5
• 字数: 3281字
• 语种: 中文

摘要

目的:基于分子反向对接技术,以黄连碱为研究对象,对TLR4/NF-κB、p38、JAK2/STAT3 3条通路上的蛋白进行反向筛选,以筛选出黄连碱的炎症靶标蛋白.方法:获取Toll样受体4/核因子(TLR4/NF-κB)、p38促分裂原活化蛋白激酶(P38 MAPK)和Janus激酶-信号转导转录激活因子(JAK2/STAT3)3条炎症通路上的30个蛋白的晶体学结构以及黄连碱的化学结构;利用AutoDockTools对所有蛋白的晶体学结构进行标准化处理;AutoGrid对蛋白的活性位点进行格子计算;利用AutoDock对黄连碱进行反向对接模拟实验;根据对接结果自由能高低进行排序,筛选出亲和力高的靶蛋白;对筛选得到的靶蛋白进行作用力分析并作图.结果:反向筛选得到4个与黄连碱具有高亲和性的靶蛋白,4个靶蛋白分别为PI3Kδ、PI3Kγ、IKKβ、PI3Kα.结论:黄连碱对P13Kδ、PI3Kγ、IKKβ、Pl3Kα靶蛋白具有竞争抑制的活性,提示黄连碱可以通过抑制该4个靶蛋白进而阻碍炎症信号传递,影响下游蛋白的表达,发挥抗炎作用.