孟氏隐唇瓢虫qRT-PCR分析中内参基因的筛选

• 作者: 庞虹 张宇宏 潘畅
• 来源期刊: 环境昆虫学报
• 学科: 农学
• 关键词: 孟氏隐唇瓢虫 qRT-PCR 内参基因 表达稳定性 GeNorm软件 NormFinder软件 BestKeeper软件
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 瓢虫专栏
• 页码范围: 261-270
• 分类号: Q963|S476
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-0858.2016.02.5

摘要

选择合适的内参基因是qRT-PCR研究的关键.本文以孟氏隐唇瓢虫Cryptolaemus montrouzieri Mulsant为研究材料,利用qRT-PCR技术,对孟氏隐唇瓢虫4个候选内参基因Actin、RPS23、GAPDH和β-tubulin的mRNA的表达量进行了分析,并用GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件分析它们在孟氏隐唇瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织中的表达稳定性.结果表明,以成虫不同组织为材料时,综合三种软件分析结果显示4个候选基因表达稳定性平均等级值排名为RPS23(rank=1)＞β-tubulin(rank=2.3)＞GAPDH(rank=3)＞Actin(rank=3.7),以不同发育时期虫体为材料时,综合分析结果显示4个候选内参基因表达稳定性平均等级值排名为RPS23(rank=1.7)＞Actin(rank=2)＞GAPDH(rank=2.7)＞β-tubulin(rank=3.7).综合分析在瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织两种处理下,三种软件的评价效果,4个候选基因表达稳定性等级值的总平均排名为RPS23 (rank=1.3) ＞Actin(rank =2.8)=GAPDH (rank =2.8)＞β-tubulin (rank =3).RPS23在瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织中均显示出较高的表达稳定性及与其它基因之间极大的相关性,可以确定为孟氏隐唇虫不同发育阶段及成虫不同组织基因表达分析中一个稳定表达的基因,可作为单个内参基因或者其它内参基因的协同基因,本实验为开展孟氏隐唇瓢虫功能基因表达分析奠定了方法学基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘畅	有害生物控制与资源利用国家重点实验室中山大学生命科学学院	1	3	1.0	1.0
2	张宇宏		2	5	2.0	2.0
3	庞虹	有害生物控制与资源利用国家重点实验室中山大学生命科学学院	1	3	1.0	1.0