Comparative genomic analysis ofLactobacillus plantarum ZJ316 reveals its genetic adaptation and potential probiotic profiles

• 来源期刊: 浙江大学学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）
• 关键词: 植物乳杆菌 ZJ316 比较基因组学 益生菌 适应性
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 页码范围: 569-579
• 页数: 11页
• 语种: 英文

摘要

题目：比较基因组学揭示植物乳杆菌ZJ316的生境适应性及潜在益生特性目的：前期研究发现植物乳杆菌ZJ316能显著抑制病原菌，促进仔猪生长，提高猪肉质量等，本研究拟在ZJ316全基因组测序的基础上，运用比较基因组学手段揭示与其生境适应性及益生特性相关基因。创新点：首次从基因水平上分析与植物乳杆菌ZJ316的生境适应性、抑菌活性及益生特性等相关的基因，为进一步揭示其生理功能打下基础。方法：运用BLASTN、Mauve和MUMmer等将植物乳杆菌ZJ316全基因组序列与已测序的8个植物乳杆菌全基因组序列进行比对及分析；用CRISPRFinder寻找CRISPR重复序列。结论：植物乳杆菌ZJ316包含碳水化合物的运输和代谢、蛋白水解酶系统和氨基酸的生物合成等相关基因，具有CRISPR、应激反应、耐胆盐、粘附宿主肠壁、胞外多糖、生物合成和细菌素生物合成等相关基因。这些基因的功能是其作为益生菌的重要特征和基础。