‘库尔勒香梨’kfpNAC基因的克隆和表达分析

• 作者: 全绍文 孙晓霞 曹福军 李陈静 牛建新 王博慧 裴茂松 赵欢
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: ‘库尔勒香梨’ NAC 萼片脱落 生物信息学 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 523-533
• 页数: 11页
• 分类号: S661.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20150351

摘要

[目的]筛选‘库尔勒香梨’萼片脱落与宿存相关基因,研究其在脱萼组和宿萼组样品中的表达情况.[方法]以‘库尔勒香梨’脱萼和宿萼花器官转录组测序数据为基础,从Unigenes中选出一条转录组和数字表达谱测序结果共有的与萼片脱落相关的具有NAC结构域的差异基因,命名为kfpNAC,对其进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR分析其在花期不同阶段不同器官中的表达量.[结果]kfpNAC的序列长度是1612 bp,包含一个编码308个氨基酸的长度为927bp的开放阅读框(ORF),一个294 bp的5’端非编码区和一个391 bp的3’端非编码区,并且在3’端非编码区有一个polyA结构.‘库尔勒香梨’kfpNAC核酸和氨基酸序列与其他植物的NAC基因具有高度的同源性.实时荧光定量结果显示其在盛花期脱萼组全花样品中的表达量显著高于宿萼组全花和子房,并且在盛花期子房中的表达量显著高于萼片.[结论]克隆和鉴定了一个新的‘库尔勒香梨’kfpNAC基因,属于NAC基因家族的NAM亚群,该基因与‘库尔勒香梨’萼片脱落密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	牛建新		74	762	17.0	23.0
2	全绍文		5	1	1.0	1.0
3	孙晓霞		4	9	1.0	3.0
4	王博慧		3	9	1.0	3.0
5	裴茂松		2	0	0.0	0.0
6	李陈静		2	0	0.0	0.0
7	曹福军		5	8	1.0	2.0
8	赵欢		7	1	1.0	1.0