棉花MAPKs家族成员的聚类分析

• 作者: 张文蔚 张珊珊 段江燕 简桂良 翟伟卜 郭安慧 郭慧敏 齐放军
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 雷蒙德氏棉 亚洲棉 MAPKs 生物信息学 同源比对 聚类分析
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 425-433
• 页数: 9页
• 分类号: S562.03
• 字数: 3903字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/issn.1002-7807.201605001

摘要

MAP激酶(促分裂原活化蛋白激酶)级联信号通路(MAPKs)由3种级联磷酸化的蛋白激酶MAPKKK、MAPKK和MAPK组成,在调控植物的生长发育、胁迫响应及抗病反应等过程中都起重要作用.为了全面了解棉花MAPK、MAPKK、MAPKKK家族各成员间的关系,进而研究和揭示MAPKs在棉花抗病、抗逆中的作用,利用已公布的雷蒙德氏棉和亚洲棉基因组数据,并从NCBI数据库中收集陆地棉的MAPKs氨基酸序列,运用生物信息学的方法对棉花(陆地棉、雷蒙德氏棉、亚洲棉)MAPK、MAPKK和MAPKKK家族的氨基酸序列进行了同源比对和聚类分析.结果表明:棉花MAPK家族具有特征性结构TEY磷酸化位点或TDY磷酸化位点,依据其氨基酸序列可划分为A、B、C和D族,其中TEY类包含A、B和C族,TDY类只包含D族;棉花MAP-KK家族具有特征性保守区域S/T-X5-S/T和活性部位基序D(I/L/V)K,并依据其氨基酸序列也可将其划分为A、B、C和D族;棉花MAPKKK家族具有MEKK特征性保守区域G(T/S)PX(W/Y)MAPEV和Raf特征性保守区域GTXX (W/Y)MAPE (L/V),进而分为MEKK类和Raf类2组亚群.本研究梳理了棉花MAPKs中的MAPK、MAPKK、MAPKKK家族各成员间的关系,为进一步研究棉花MAPKs信号传导途径和揭示其在棉花抗病、抗逆中的作用提供了基础信息.