猪链球菌Lmb、Sao、ZnuA蛋白的抗原表位、二级结构分析及重组表位疫苗分子的设计

• 作者: 刘祥
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 农学
• 关键词: 猪链球菌 细胞表位 蛋白结构 重组表位多肽
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 开发与应用
• 页码范围: 181-187,204
• 页数: 8页
• 分类号: S855.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2016.02.0033

摘要

[目的]利用生物信息学方法设计猪链球菌候选疫苗蛋白Lmb、Sao、ZnuA的重组表位多肽分子.[方法]通过ABCpred和BepiPred方案,预测猪链球菌Lmb、Sao、ZnuA蛋白的B细胞表位.运用神经网络与量化矩阵法预测蛋白的CTL表位.使用MHC-Ⅱ类分子结合肽预测蛋白的Th表位.采用DNASTAR软件与SOPMA服务器预测蛋白二级结构,进而验证获得的B/T细胞表位的准确性.通过DNASTAR Protean软件重组拼接获得的B/T细胞抗原表位,设计抗原性较好的猪链球菌重组表位多肽.[结果]猪链球菌Lmb、Sao、ZnuA蛋白的优势B细胞表位数分别为4个、4个和3个;CTL表位数各为1个;Th表位数分别为2个、1个和1个.二级结构预测显示这些表位大多处于蛋白易于产生表位的暴露表面、无规则卷曲与转角等位置.并设计获得抗原性较好的重组表位多肽.[结论]设计了抗原性较好的猪链球菌Lmb、Sao、ZnuA蛋白的重组表位多肽.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘祥		22	92	6.0	8.0