沙冬青 AmCIP 基因结构及其内含子生物信息学分析

• 作者: 于婷乔 刘胜利 卢存福 陈玉珍 雷晨
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 沙冬青 脱水素基因AmCIP 外显子 内含子 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 93-99
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.09.013

摘要

旨在分析沙冬青 AmCIP 基因 DNA 序列结构特性及功能。以沙冬青 AmCIP 基因的 cDNA 序列设计引物，采用 PCR扩增其 DNA 序列，并利用生物信息学方法分析基因的结构。序列分析表明，沙冬青 AmCIP 基因 DNA 序列长1548 bp，包含2个外显子和1个内含子，GenBank 登录号 KU744005。在该基因的 ORF 内存在一个78 bp 的内含子序列，同时内含子序列中含有参与厌氧诱导的类增强子元件（GC-motif）和光响应元件（TCCC-motif），3'-UTR 区域含有多个参与光响应、胁迫响应和激素响应等相关的顺式作用元件，而5'-UTR 区域只含有赤霉素响应元件（GARE-motif），这些元件可能对 AmCIP 基因转录表达起调控作用。此外，该基因具有较高的 A+T 碱基含量（64.7%），AmCIP 的内含子不具有 GT-AG 规则的保守序列，即内含子5'碱基是 GT，3'碱基是 TG，推测 AmCIP 的 mRNA 具有独特的剪切机制。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈玉珍	北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室教育部林木花卉遗传育种重点实验室	23	278	9.0	16.0
2	雷晨	北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室教育部林木花卉遗传育种重点实验室	4	10	2.0	3.0
3	刘胜利	北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室教育部林木花卉遗传育种重点实验室	3	17	2.0	3.0
4	于婷乔	北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室教育部林木花卉遗传育种重点实验室	2	7	1.0	2.0