鳀科(Engraulidae)鱼类DNA条形码电子芯片研究

• 作者: 庄志猛 李献儒 李达 柳淑芳
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 鳀科 DNA条形码 探针 DNA芯片 电子杂交
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 19-25
• 页数: 7页
• 分类号: S917
• 字数: 4891字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11758/yykxjz.20151203001

摘要

本研究将基于线粒体COⅠ部分序列的DNA条形码和DNA芯片技术相结合,以鳀科11属30种鱼类为研究对象,在比对分析其DNA条形码序列的基础上,利用软件Oligo Array 2.1筛选探针,经OligoCalc优化探针,去除易形成发夹(Hairpin)、茎环(Stem-loop)及自身二聚体结构(Homodimers)的探针,再利用Oligo heat map对探针与靶标序列进行虚拟杂交,共有14个物种的24条探针能与靶标序列特异性结合.利用DNA条形码芯片技术能将14个物种鉴定到种,虽然物种识别能力仅占总物种数的46.7％,但鉴定准确率可达100％.因此,基于COⅠ基因的DNA芯片技术对鳀科鱼类物种鉴定有一定的实用价值,但该技术对物种的识别能力尚有较大提升空间,通过筛选和优化得到高质量的分子探针则是突破该项技术的关键.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柳淑芳	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	4	32	3.0	4.0
5	李献儒	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	1	2	1.0	1.0
9	李达	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	1	2	1.0	1.0