亚洲棉bZIP蛋白家族的鉴定及GaFD基因的组织表达分析

• 作者: 张彦楠 蔡大润 黄先忠
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 碱性亮氨酸拉链 亚洲棉 FD 进化分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种?种质资源?分子遗传学
• 页码范围: 832-843
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2016.00832

摘要

碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper, bZIP)是真核生物中数量最多并且最具多样性的转录因子之一,参与植物生长发育及响应生物和非生物胁迫。本研究利用亚洲棉(Gossypium arboreum)全基因组数据库,通过生物信息学分析分布在13条染色体上的159个bZIP家族基因的全序列。系统进化、基因结构和保守基序分析表明这些基因分成13个亚家族。其中, A亚家族有3个GaFD基因GaFD1、GaFD2和GaFD3,通过实时荧光定量PCR分析3个GaFD基因在不同组织中的表达,结果表明GaFD1和GaFD2在SAM中的表达量最高, GaFD3在茎中表达量最高。研究表明棉花基因组中具有数量众多的bZIP家族成员,不同基因结构及FD基因不同的表达特征表明bZIP基因在棉花生长发育中可能具有不同的功能,这些结果为进一步解析棉花bZIP家族基因的功能和作用机理积累了有价值的资料。