人巨细胞病毒潜伏感染状态下编码miRNA的研究

• 作者: 吕丽萍 周锡鹏 宋鑫 张艳宇 毕静媛 肖军 许金波 邓江 马平 高博
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 医学
• 关键词: 人巨细胞病毒 潜伏感染 深度测序 生物信息学 微小RNA
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 311-315
• 页数: 5页
• 分类号: R373
• 字数: 4516字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2016.04.011

摘要

目的：探索潜伏感染状态下人巨细胞病毒（HCMV）所编码微小RNA（microRNA，miRNA），为研究其在HCMV病毒学和潜伏感染机制奠定基础。方法通过HCMV感染THP－1细胞构建HCMV潜伏感染细胞模型，采用高通量Solexa测序平台对其深度测序，并利用 RNAFold 等生物信息学软件进行二级结构预测和命名。结果HCMV在潜伏感染状态表达了miR－US25－2－3p、miR－US25－2－5p、miR－UL112、miR－US25－1、miR－UL22A 以及长度为25 bp的编号为PC－5p－148467的miRNA，对PC－5p－148467进行系列分析，将其命名为hcmv－miR－US33as－5p。结论在潜伏感染状态下，HCMV亦可编码多种miRNA。