利用高密度SNP遗传图谱定位小麦穗部性状基因

• 作者: 刘凯 孙彩铃 张莹 李青芳 田纪春 邓志英 陈建省
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 普通小麦 90k基因芯片 QTL定位 穗部 SNP
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种?种质资源?分子遗传学
• 页码范围: 820-831
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2016.00820

摘要

小麦穗部性状之间相关性密切,其中穗粒数和千粒重是重要的产量构成要素,挖掘与穗部性状相关联的基因位点对分子标记辅助育种及解释基因效应具有重要意义。本研究以RIL群体(山农01-35×藁城9411)173个F8：9株系为材料,利用90 k小麦SNP基因芯片、DArT芯片技术及传统的分子标记技术构建的高密度遗传图谱,在5个环境下进行穗部相关性状QTL定位。检测到位于1B、4B、5B、6A染色体上7个控制千粒重的加性QTL,解释表型变异率6.00%~36.30%,加性效应均来自大粒母本山农01-35；检测到8个控制穗长的加性 QTL,解释表型变异率14.34%~25.44%；3个控制穗粒数的加性QTL；5个控制可育小穗数的加性QTL；3个控制不育小穗数的加性QTL,贡献率为8.70%~37.70%；4个控制总小穗数的加性QTL；6个控制小穗密度的加性QTL。通过基因型与环境互作分析,检测到32个加性 QTL,解释表型变异率0.05%~1.05%。在4B染色体区段 EX_C101685–RAC875_C27536检测到控制粒重、穗长、穗粒数、可育小穗数、不育小穗数、总小穗数的一因多效 QTL,其贡献率为5.40%~37.70%,该位点在多个环境中被检测到,是稳定主效QTL。在6A染色体wPt-0959-TaGw2-CAPS区间上检测到控制粒重、总小穗数的QTL。研究结果为穗部性状的分子标记开发、基因精细定位和功能基因克隆奠定了基础。