中国明对虾（Fenneropenaeus chinensis）coat-ε基因全长cDNA克隆及组织分布

• 作者: 刘庆慧 吴垠 王修芳 黄倢
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 中国明对虾 coat-ε 基因克隆 组织分布
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 147-152
• 页数: 6页
• 分类号: S945
• 字数: 3796字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11758/yykxjz.20150617002

摘要

coat-ε基因表达的蛋白是组成 COPⅠ的 coatomer 复合体的一个亚基，为获得中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis) coat-ε基因全长序列，采用cDNA末端快速扩增(Rapid amplification of cDNA end, RACE)技术，扩增出coat-ε基因的3￠端和5￠端，测序结果经DNAMAN比对拼接得出coat-ε基因全长，基因全长1402 bp，5￠非编码区(UTR)84 bp，3￠非编码区(UTR)310 bp，开放阅读框1008 bp，预测编码335个氨基酸，其中，第230–300的氨基酸属于TPR超家族，SignalP 3.0 Server预测氨基酸序列没有信号肽，TMHMM Server v.2.0分析此氨基酸不存在跨膜结构，PSORTⅡ Prediction预测该蛋白位于线粒体、细胞质、内质网中，属胞内蛋白。系统进化树显示，中国明对虾的coat-ε基因与节肢动物门的动物亲缘关系相近。采用实时荧光定量方法分析该基因在鳃、上皮、胃、肌肉、肝胰腺等不同组织中的相对表达，结果显示，coat-ε在肌肉中的相对转录表达量最高，在鳃和附肢的表达次之。本研究获得的中国明对虾coat-ε全长序列，可为该基因功能研究提供基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘庆慧	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	16	108	6.0	9.0
7	吴垠		17	132	8.0	11.0
11	王修芳		1	4	1.0	1.0