三氢-咪唑并[4,5-c]喹啉-4(5H)-酮衍生物与二肽基肽酶-4结合机理的理论研究

• 作者: 朱小蕾 杨雪雨 王璇 董珂珂
• 来源期刊: 南京师大学报（自然科学版）
• 学科: 化学
• 关键词: 分子动力学模拟 MM-PBSA 二肽基肽酶 三氢-咪唑并[4,5-c]喹啉-4(5H)-酮衍生物抑制剂
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 化学
• 页码范围: 62-66
• 页数: 5页
• 分类号: O643.1
• 字数: 2585字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4616.2016.03.011

摘要

通过分子对接、分子动力学(MD)模拟和结合自由能分析的方法研究了三氢-咪唑并[4,5-c]喹啉-4(5H)-酮衍生物药物与二肽基肽酶之间的成键机制,分析和讨论了抑制剂和相邻残基之间的氢键和疏水相互作用.用MM-PBSA方法计算得到的4个抑制剂的结合自由能与实验上测得的结果是一致的.抑制剂与DPP-4的关键残基间的范德华相互作用对于体系的结合能有较大的贡献,并且是区分不同抑制剂生物活性的标志之一.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王璇	南京工业大学化工学院材料化学工程国家重点实验室	6	5	2.0	2.0
2	朱小蕾	南京工业大学化工学院材料化学工程国家重点实验室	44	52	4.0	6.0
3	董珂珂	南京工业大学化工学院材料化学工程国家重点实验室	7	1	1.0	1.0
4	杨雪雨	南京工业大学化工学院材料化学工程国家重点实验室	7	1	1.0	1.0