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2014年中国不同地区对虾白斑综合征病毒ORF14/15和ORF23/24缺失区序列比较
2014年中国不同地区对虾白斑综合征病毒ORF14/15和ORF23/24缺失区序列比较
作者:
万晓媛
刘庆慧
孙新颖
黄倢
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
WSSV
ORF14/15
ORF23/24
序列分析
摘要:
对虾养殖面临诸多病害威胁,对虾白斑综合征病毒(White spot syndrome virus, WSSV)是养殖对虾主要病原之一,WSSV不同地理株的变异可能导致WSSV毒力的变化。为了解2014年中国大部分地区WSSV ORF14/15和ORF23/24的变异情况,本研究选择2014年1月–8月期间采集的48份WSSV阳性样本,用特异引物扩增ORF14/15和ORF23/24片段,连接于T载体,转化至Top10中,筛选阳性克隆,测序分析不同样本之间的缺失差异。结果显示,能够扩增ORF14/15和ORF23/24样品的比例分别为43.75%和33.33%。在ORF14/15扩增中,分别扩增出1260 bp、1270 bp、1892 bp和2662 bp片段,与TH-96-Ⅱ比对共有4种缺失情况,即缺失6540 bp、6530 bp、5908 bp和5138 bp。而在ORF23/24扩增中,分别扩增出1140 bp和1146 bp片段,与中国台湾株(TW)比对有两种缺失情况,即缺失12070 bp和12064 bp。研究结果表明,WSSV在中国大部分地区存在一定程度的变异,而不同毒株之间在ORF14/15可变区差异比较明显,在ORF23/24可变区差异不大,但均具有大片段缺失。
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篇名
2014年中国不同地区对虾白斑综合征病毒ORF14/15和ORF23/24缺失区序列比较
来源期刊
渔业科学进展
学科
农学
关键词
WSSV
ORF14/15
ORF23/24
序列分析
年,卷(期)
2016,(4)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
140-146
页数
7页
分类号
S945
字数
4309字
语种
中文
DOI
10.11758/yykxjz.20150527001
五维指标
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ORF23/24
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
渔业科学进展
主办单位:
中国水产学会
中国水产科学研究院黄海水产研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7075
CN:
37-1466/S
开本:
大16开
出版地:
山东省青岛市南京路106号(黄海水产研究所)
邮发代号:
24-153
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
2367
总下载数(次)
4
总被引数(次)
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