DNA条形码技术在鲻科鱼类鉴定中的应用

• 作者: 刘璐 孙典荣 宋娜 李纯厚 韩志强 高天翔
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 鲻科 COI基因 DNA条形码 物种鉴定 系统发育
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 渔业资源与捕捞技术
• 页码范围: 178-186
• 页数: 9页
• 分类号: S931
• 字数: 4555字
• 语种: 中文

摘要

本研究选用DNA条形码的通用基因片段,采用特异性扩增测序及与GenBank已有序列结合分析的方法,进行了鲻科(Mugilidae)6属17种鱼类的COI基因片段的序列比较、分子树构建和系统进化研究.研究表明,在所得的17种鲻科鱼类共有的555bp COI基因片段中平均GC含量为46.9％.其中,第二密码子位点含量最高(49.8％～56.2％),平均54.9％;第一密码子变化范围最大(31.9％～48.6％),平均42.9％;第三密码子差别不显著(42.5％～43.4％),平均42.7％.依据Kimura-2-parameter模型(K2P),17种鲻科鱼类种内遗传距离的平均值为0.004 5,种间遗传距离为0.191,是种内遗传距离的42倍.在分子系统树上,所有物种均呈单系,5属为独立分支,只有隶属于梭属(Liza)的尖头梭(Lizatade)与莫鲻属(Moolgarda)聚类,表现出与传统形态学分类不一致的结果.本研究结果验证了线粒体COI基因作为DNA条形码对鲻科鱼类进行物种鉴定的有效性,可用于辅助探讨鲻科科下属、种分类阶元系统发育问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙典荣	中国水产科学研究院南海水产研究所	37	640	16.0	24.0
2	李纯厚	中国水产科学研究院南海水产研究所	81	1369	21.0	34.0
3	刘璐	中国海洋大学水产学院	18	113	6.0	10.0
4	韩志强	浙江海洋大学水产学院	38	141	7.0	10.0
5	高天翔	浙江海洋大学水产学院	31	90	5.0	8.0
6	宋娜	中国海洋大学水产学院	37	302	10.0	16.0