GmHIR1基因的功能预测及表达分析

• 作者: 于仁敬 付营 刘丽敏 刘春燕 刘洋 张艳娇 李长育 辛大伟 陈琳
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 HIR1 生物信息学 表达分析 疫霉菌
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 265-271
• 页数: 7页
• 分类号: S435.651
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2016.03.0047

摘要

[目的]获取GmHIR1相关生物信息学信息,分析与其他植物HIR的进化亲缘关系,进行启动子原件和结构的预测,分析其潜在调控功能,并研究该基因在疫霉菌侵染大豆过程中的表达情况.[方法]利用生物信息学软件对Gm-HIR1进行分析和功能预测,将大豆疫霉菌侵染抗病品种绥农10号和感病品种合丰25,分7个时间点进行取样,对Gm-HIR1的表达情况进行qRT-PCR分析.[结果]GmHIR1启动子含有11个作用元件,该基因编码蛋白含有stomatins和prohibitin两个结构域,表达分析表明GmHIR1在接种疫霉菌36 h之前,在抗病品种绥农10号中表达明显增加,而在感病品种合丰25中变化不明显,36 h之后,在两个品种的表达量变化趋势相似.[结论]GmHIR1与多种生理反应相关,并且确认GmHIR1与抗病大豆防御疫霉菌相关.