西瓜bHLH转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

• 作者: 何洁 张勇 张显 李好 杨小振 杨建强 顾秀容 马建祥 魏春华
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 西瓜 bHLH 全基因组鉴定 胁迫响应 基因表达
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 蔬菜
• 页码范围: 281-294
• 分类号: S651
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0886

摘要

利用生物信息学方法,在西瓜测序基因组97103中共鉴定出96个bHLH家族成员,其中有94个可以被定位到西瓜的11条染色体上.通过基因结构和结构域序列保守性的预测,发现这些基因的序列长度和内含子数量变化很大,但bHLH结构域序列比较保守.用拟南芥中39条已知的bHLH蛋白序列和西瓜的96条bHLH蛋白序列构建系统发育树,结果显示西瓜的bHLH家族可以进一步被分为11个亚族.运用荧光定量实时PCR技术,分析了该家族中21个基因在西瓜响应非生物胁迫时的表达水平,结果表明,8个基因受低温胁迫诱导表达,13个基因受ABA胁迫诱导表达,14个基因受盐胁迫诱导表达.ClabHLH41 在3种胁迫下表达量均显著增加,说明其在低温、ABA和盐胁迫应答中可能发挥着重要作用.