不同来源 SSR 和 EST－SSR 在披碱草属和鹅观草属物种中的通用性分析

• 作者: 周凯 张新全 陈仕勇 陈智华 马啸
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: SSR 披碱草属 鹅观草属 通用性 系统关系
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 132-140
• 页数: 9页
• 字数: 4699字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11686/cyxb2015324

摘要

披碱草属和鹅观草属是禾本科小麦族两个重要的多年生属，其种属界限及系统关系一直存在争议，是其种质资源利用的难点。本研究基于小麦族中不同来源的已开发的 SSR 标记，筛选出在披碱草属和鹅观草属中高通用性的 SSR 标记，为其生物系统关系研究提供重要参考。试验选用了来自小麦族小麦、大麦、披碱草属、拟鹅观草属及赖草属5个属的230个 SSR 和 EST－SSR 标记对小麦族 St、H、Y 基因组的23个物种进行了 SSR 扩增及通用性分析。结果表明，1）在筛选的230个标记中，163个（70．87％）SSR 和 EST－SSR 标记能在所有的供试物种中扩增出清晰的条带，在披碱草属和鹅观草属等物种中表现出了较高的通用性；2）在扩增出的163个 标 记 中，EST－SSR （87．60％）比基因组 SSR（49．50％）标记在种属间表现出了较高的通用性，而基因组 SSR 标记（85．98％）则比EST－SSR（79．37％）标记表现出更高的多态性；3）163个标记在供试物种中共扩增出579个清晰条带，其中多态性条带为533个，多态性比率为92．05％；每个标记扩增的条带数变化为1～11条，平均扩增条带数为3．55条；4）基于 UPGMA 聚类结果与供试物种的基因组之间表现出了较高的相关性，相同或相似基因组物种间表现出较近的亲缘关系，其中 H 基因组与 St 基因组的亲缘关系较远，H 基因组二倍体物种与其他物种也表现出了较远的亲缘关系。本研究选用的5个属的 SSR 和 EST－SSR 标记均能在披碱草属和鹅观草属物种中扩增，最后共筛选出了163个高通用性的 SSR 和 EST－SSR 分子标记，揭示了供试物种及不同基因组间的亲缘关系，为下一步披碱草属和鹅观草属的种属关系及系统学研究提供了重要参考。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张新全	四川农业大学草业科学系	321	4797	35.0	49.0
2	陈智华	西南民族大学生命科学与技术学院	68	648	14.0	22.0
3	马啸	四川农业大学草业科学系	103	1284	20.0	30.0
4	陈仕勇	四川农业大学草业科学系	35	148	7.0	11.0
8	周凯	四川农业大学草业科学系	5	46	3.0	5.0